Atık su arıtma tesislerinde en küçük ama en önemli yardımcılar olan mikroorganizmalar olmadan biyolojik atık su arıtımı mümkün olmazdı.Abway Atık su arıtma tesisleri, mikroorganizmaların kimyasal bileşiklerin dönüştürülmesinden ve kirletici maddelerin bozulmasından sorumlu olduğu devasa mikrobiyolojik enerji santralleridir. Tesisteki bir rahatsızlık, genellikle mikrobiyal süreçlerin bozulmasına dayanır. Bu nedenle, bitkinin biyosinozunu bilmek ve bunu yaparken süreçlerini kontrol altında tutmak önemlidir.
Mikroorganizmaların konvansiyonel tespiti hala kültivasyonlarına dayanmaktadır ve atık su gibi karmaşık numunelerin analizi için pek uygun değildir. Çalışmalar, atık sudaki tüm bakterilerin% 99,9'unun yetiştirilemediğini göstermektedir. Ancak, özgüllük eksikliğinden ve bakterinin morfovaryabilitesinden veya gram değişkenliğinden dolayı basit boyama yöntemleri bile yeterli değildir. Bir atık su arıtma tesisinde mikrobiyolojik koşulların gerçekçi bir resmini elde etmek için, bakterileri doğrudan numunede ve herhangi bir sapma olmaksızın analiz etmek gerekir.